复旦儿科医院创建于1952年，系卫生部部属“三级甲等”医院，是集医教研为一体的综合性儿童专科医院，上海市红十字会团体会员单位，全国儿科学重点学科、国家“211工程”重点学科建设单位，国家儿科学硕士、博士学位授权点，临床医学（儿科学组）博士后流动站。中华医学会儿科学分会、上海医学会儿科学分会、上海医学会小儿外科学分会主任委员单位。多次被评为上海市文明单位。
复旦儿科医院核定床位450张，开放床位600张，每年门急诊服务量120万左右，住院数逾1.8万人次，住院手术6000余人次，门诊手术逾10000人次。现有职工 1000余人，博士生导师17名，硕士生导师28名，高级职称专家101人。
复旦儿科医院专业设置齐全，共有39个临床医技科室，新生儿、外科、心血管、传染病等专业先后被列为卫生部临床学科重点专业，新生儿科是上海市医学重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症临床医学中心，呼吸急救专业是上海市医学领先专业。
多年来，复旦儿科医院先后承担了国家“七五”、“八五”、“九五”、“十五”攻关研究课题和“863”项目，以及国家自然科学基金，卫生部、上海市、学校及CMB等各级科研项目。
复旦儿科医院高度重视对外学术交流，努力构建儿科医学国际交流的桥梁。立足内涵质量建设，拓展交流合作机会，先后与18个国际上知名的医学机构和国内十多个医疗单位建立了友好协作关系。
复旦儿科医院始终坚持人性化管理，创建和谐的医疗环境，围绕医院中心工作，把培训与教育、管理与监督融为一体，促进精神文明建设与医院工作协调发展。
为了关注社会特殊群体，关爱弱势儿童，复旦儿科医院建立多渠道社会合作伙伴关系，吸纳社会各级人士参与慈善事业，以社会慈善活动为载体，开展形式多样的社会公益活动。
五十六年来，儿科人以“团结、奋进、严谨、创新”的院训时刻勉励自己，以“勤奋创业、无私奉献”的精神不断努力着，始终贯穿“以人为本”的服务理念，构建和谐稳定的医院文化，凝聚人心，营造规范有序的良好氛围，在全国享有较高的声誉。
复旦儿科医院在党和政府的关心和大力支持下，经过近3年的建设，一所坐落于闵行区万源路，占地160亩、建筑面积8万多平方米、开放床位600多张崭新的现代化医院已经全面对外开放，这是儿科几代人的梦想，是儿科医院新的希望。在新医院正式运转的同时，儿科医院枫林路原址继续保留一定规模的普通内科门急诊和内科专家门诊，以方便周遍病人就近就诊的需要。